崇明東灘鳥(niǎo)類(lèi)國家級自然保護區是以遷徙鳥(niǎo)類(lèi)為主要保護對象的濕地類(lèi)型自然保護區，位于長(cháng)江入?？?，在中國第三大島崇明島的最東端，它是由長(cháng)江攜帶大量的泥沙沉積而成，是長(cháng)江口地區規模最大、發(fā)育最完善的河口型潮汐灘涂濕地，其南北狹，東西寬，區內潮溝密布，高、中、低潮灘分帶十分明顯，是亞太地區遷徙水鳥(niǎo)的重要通道。

保護區區域面積為241.55平方公里，約占上海市濕地總面積的7.8%，分為核心區、緩沖區、試驗區三個(gè)部分。崇明東灘屬亞熱帶氣候，是東亞季風(fēng)盛行地區，年平均溫度15.3℃，冬季因三面受水面熱效應的影響，氣溫要比崇明島的西部高出1℃，水域不凍結，非常有利于水禽越冬，所以它成為亞太地區候鳥(niǎo)遷徙路線(xiàn)上的重要“驛站”和水禽重要的繁殖地、越冬地，也是備受?chē)鴥韧怅P(guān)注的研究河口科學(xué)問(wèn)題的理想場(chǎng)所。

保護區處于海洋，河流，陸地，島嶼的交匯地帶，生物多樣性極為復雜與獨特，盡管灘涂植被比較簡(jiǎn)單，主要有蘆葦，藨草和海三菱藨草組成，但由于生產(chǎn)量大，在灘涂淤積中起著(zhù)舉足輕重的作用，并為其他生物創(chuàng )造了良好的生存環(huán)境，同時(shí)養育著(zhù)上海地區70％－80％的物種。目前，崇明東灘已記錄到的鳥(niǎo)類(lèi)有17目50科290種。列入《中國瀕危動(dòng)物紅皮書(shū)》的鳥(niǎo)類(lèi)20種；列入中日、中澳政府間候鳥(niǎo)及其棲息地保護協(xié)定的鳥(niǎo)類(lèi)分別為156種和54種；超過(guò)世界種群數量1％的涉禽種類(lèi)至少有12種。每年在崇明東灘過(guò)境中轉和越冬的水鳥(niǎo)總量逾百萬(wàn)只，其中國家一級保護的鳥(niǎo)類(lèi)有東方白鸛、黑鸛、白頭鶴、白尾海雕4種；國家二級保護動(dòng)物35種，如黑臉琵鷺，小天鵝，灰鶴，鴛鴦，小杓鷸，小青腳鷸等。在崇明東灘主要有四種類(lèi)型的鳥(niǎo)群，它們分別是鸻鷸類(lèi)，雁鴨類(lèi)，鶴類(lèi)群和鷗類(lèi)群。

根據10余年的調查，尤其是1996－1998年連續三年北遷涉禽和越冬水禽調查表明，崇明東灘是候鳥(niǎo)遷徙路線(xiàn)上的重要驛站，同時(shí)崇明東灘又是白頭鶴，小天鵝等珍稀水禽的重要越冬地，其中國家一級保護鳥(niǎo)類(lèi)白頭鶴已連續十余年選擇崇明東灘作為越冬地，數量達到130余只。

崇明東灘還是多種生物周年性溯河和降河洄游的必經(jīng)通道，在現有的10種獸類(lèi)、73種魚(yú)類(lèi)和31種甲殼類(lèi)當中，許多重要種類(lèi)，如：國家一級保護野生動(dòng)物白暨豚和中華鱘、經(jīng)濟特產(chǎn)種類(lèi)大閘蟹和素有“軟黃金”之稱(chēng)的鰻苗等，還有如泥螺，日本沼蝦，海瓜子，等種類(lèi)繁多，資源豐富的經(jīng)濟動(dòng)物，它們的重要生活史，如覓食、繁殖、幼體育肥等都依賴(lài)這一特殊水域。崇明東灘現已查明的物種還包括兩棲爬行動(dòng)物16種、軟體動(dòng)物21種、環(huán)節動(dòng)物13種、昆蟲(chóng)73種。

保護區大事記：

1992年，國務(wù)院10部委制定的《中國生物多樣性保護行動(dòng)計劃》將崇明東灘列入優(yōu)先保護序列；

1998年，保護區經(jīng)上海市人民政府批準建立；

1999年4月正式設立保護區管理處，現隸屬于上海市綠化管理局（市林業(yè)局）；

1999年7月，崇明東灘被濕地國際亞太組織接納為“東亞——澳大利西亞遷徙涉禽保護區網(wǎng)絡(luò )”成員單位；

2002年1月，保護區及毗鄰的84平方公里人工濕地被列為國際重要濕地；

2005年7月，經(jīng)國務(wù)院批準晉升為國家級自然保護區；

2005年11月，中國野生動(dòng)物保護協(xié)會(huì )授予全國的12個(gè)“中國鳥(niǎo)類(lèi)之鄉”中，崇明榮獲“白頭鶴之鄉”之美譽(yù)。

2006年10月，由國家林業(yè)局授牌，列入全國首批51個(gè)國家級示范自然保護區。